※2023年7月19日 一部修正 VCF形式 詳しい説明は省略。GATK公式による解説がおそらく一番分かりやすい。 VCFファイルを整形したり、ほしい多型情報を抽出するツールとしてはbcftoolsとVCFtoolsが定番となっている。個人的にはbcftoolの方が、 biocondaで配布…

ここ数年、中国のゲノム関連企業であるBGIの次世代シーケンサーがゲノム解読に使われることが増えてきた。配列の増幅にローリングサークル複製機構を使っているなど、illumina社のシーケンサーとはだいぶシステムが異なるらしい。1当然、使われているアダプ…