※2023年7月19日 一部修正 VCF形式 詳しい説明は省略。GATK公式による解説がおそらく一番分かりやすい。 VCFファイルを整形したり、ほしい多型情報を抽出するツールとしてはbcftoolsとVCFtoolsが定番となっている。個人的にはbcftoolの方が、 biocondaで配布…

形態などのデータからそれなりに多様性があることがわかっている個体群について、各個体の全ゲノム的な多型データが得られているとする。 このとき、 1. その集団を遺伝的に同じ起源を持つグループ（＝祖先集団）に分けた場合、どのように分けられるか？ 2. …